Myco-BioBrick

Patricia Thébault
Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique, UMR 5800 CNRS

Pascal Sirand-Pugnet
UMR 1332 Biologie du Fruit et Pathologie INRA

 

Le projet Myco-BioBrick s’inscrit dans l’axe Génomes, cellules et organismes minimaux, ingénierie génomique de l’Appel à Projets 2014 de l’Action Thématique « Synthetic Biology Bordeaux (SB2)». Il a pour objet la caractérisation et le design de systèmes de régulation impliquant les ARN non codants (ARNnc) chez les mycoplasmes. L’identification de tels systèmes constitue l’un des challenges actuels de la Biologie de Synthèse, dans le but de disposer de moyens de controle efficace sur l’expression de groupes de gènes d’intérêt. Le design de telles “Biobricks” implique de connaître précisément l’ensemble des composants du système et d’établir de manière précise l’ensemble des interactions entre ces composants. Nous proposons de combiner des approches expérimentales et bioinformatiques pour caractériser les réseaux de régulation de l’expression des gènes impliquant deux ARNnc apparentés décrits chez une bactérie minimale, Mycoplasma capricolum, dans le but final de produire un dispositif de régulation utlisable chez les mycoplasmes. Le projet Myco-BioBrick comprend trois volets : (1) Détermination des transcriptomes et protéomes de M. capricolum et de mutants produits par biologie de synthèse et affectés dans l’expression d’un ou deux ARNnc, (2) inférence des réseaux de régulation impliquant ces deux ARNnc et, (3) design d’une Biobrick de régulation.

 

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Nominees 2014